El Tribunal de Cuentas ha adoptado un informe especial sobre las operaciones emprendidas por la Unión Europea en el campo de la seguridad nacional en los países de Europa Central y Oriental (PECO) y en los nuevos Estados independientes (NEI) durante el período 1990-1997. Sus críticas se centran principalmente en la lentitud y desorganización del desarrollo de los programas, frente a lo cual la Comisión se defiende alegando falta de personal y sobre todo de fondos, que solo permiten una estrategia limitada de concienciación y asistencia técnica.